Protein–RNA interactions for Protein: Q8N370

SLC43A2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A2Q8N370 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A2Q8N370 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC43A2Q8N370 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC43A2Q8N370 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A2Q8N370 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A2Q8N370 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A2Q8N370 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC43A2Q8N370 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A2Q8N370 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A2Q8N370 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A2Q8N370 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A2Q8N370 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC43A2Q8N370 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms