Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2J2Q8N2K1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2J2Q8N2K1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2J2Q8N2K1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2J2Q8N2K1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms