Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP3Q8IZU3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP3Q8IZU3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP3Q8IZU3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP3Q8IZU3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP3Q8IZU3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP3Q8IZU3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP3Q8IZU3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP3Q8IZU3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCP3Q8IZU3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SYCP3Q8IZU3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP3Q8IZU3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms