Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM42Q8IWZ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM42Q8IWZ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM42Q8IWZ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM42Q8IWZ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms