Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPA2Q8IWL1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFTPA2Q8IWL1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFTPA2Q8IWL1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFTPA2Q8IWL1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms