Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF3Q86WH2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF3Q86WH2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF3Q86WH2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF3Q86WH2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms