Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TXNDC2Q86VQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TXNDC2Q86VQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TXNDC2Q86VQ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TXNDC2Q86VQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TXNDC2Q86VQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TXNDC2Q86VQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.4 ms