Protein–RNA interactions for Protein: Q86U90

YRDC, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YRDCQ86U90 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
YRDCQ86U90 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YRDCQ86U90 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YRDCQ86U90 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YRDCQ86U90 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YRDCQ86U90 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms