Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG4Q86SJ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSG4Q86SJ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG4Q86SJ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG4Q86SJ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms