Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
DSG4Q86SJ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DSG4Q86SJ6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DSG4Q86SJ6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
DSG4Q86SJ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
DSG4Q86SJ6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DSG4Q86SJ6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
DSG4Q86SJ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DSG4Q86SJ6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DSG4Q86SJ6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DSG4Q86SJ6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DSG4Q86SJ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DSG4Q86SJ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DSG4Q86SJ6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DSG4Q86SJ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DSG4Q86SJ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DSG4Q86SJ6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DSG4Q86SJ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DSG4Q86SJ6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
DSG4Q86SJ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
DSG4Q86SJ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DSG4Q86SJ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DSG4Q86SJ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DSG4Q86SJ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DSG4Q86SJ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DSG4Q86SJ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DSG4Q86SJ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DSG4Q86SJ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DSG4Q86SJ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DSG4Q86SJ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DSG4Q86SJ6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DSG4Q86SJ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DSG4Q86SJ6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DSG4Q86SJ6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DSG4Q86SJ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DSG4Q86SJ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DSG4Q86SJ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DSG4Q86SJ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DSG4Q86SJ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
DSG4Q86SJ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DSG4Q86SJ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DSG4Q86SJ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DSG4Q86SJ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DSG4Q86SJ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DSG4Q86SJ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
DSG4Q86SJ6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DSG4Q86SJ6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DSG4Q86SJ6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DSG4Q86SJ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DSG4Q86SJ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
DSG4Q86SJ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DSG4Q86SJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DSG4Q86SJ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DSG4Q86SJ6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DSG4Q86SJ6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DSG4Q86SJ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DSG4Q86SJ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DSG4Q86SJ6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DSG4Q86SJ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
DSG4Q86SJ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DSG4Q86SJ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DSG4Q86SJ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DSG4Q86SJ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DSG4Q86SJ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DSG4Q86SJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DSG4Q86SJ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
DSG4Q86SJ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DSG4Q86SJ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DSG4Q86SJ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG4Q86SJ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG4Q86SJ6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DSG4Q86SJ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DSG4Q86SJ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSG4Q86SJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
DSG4Q86SJ6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DSG4Q86SJ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DSG4Q86SJ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DSG4Q86SJ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSG4Q86SJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSG4Q86SJ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DSG4Q86SJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DSG4Q86SJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DSG4Q86SJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DSG4Q86SJ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DSG4Q86SJ6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DSG4Q86SJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DSG4Q86SJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DSG4Q86SJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DSG4Q86SJ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DSG4Q86SJ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DSG4Q86SJ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DSG4Q86SJ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG4Q86SJ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG4Q86SJ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG4Q86SJ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DSG4Q86SJ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DSG4Q86SJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DSG4Q86SJ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DSG4Q86SJ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DSG4Q86SJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms