Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP1Q7Z6B7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP1Q7Z6B7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRGAP1Q7Z6B7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP1Q7Z6B7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP1Q7Z6B7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP1Q7Z6B7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP1Q7Z6B7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP1Q7Z6B7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP1Q7Z6B7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms