Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5Q1

CPEB2, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB2Q7Z5Q1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPEB2Q7Z5Q1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPEB2Q7Z5Q1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPEB2Q7Z5Q1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms