Protein–RNA interactions for Protein: Q7LG56

RRM2B, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2BQ7LG56 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RRM2BQ7LG56 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRM2BQ7LG56 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRM2BQ7LG56 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRM2BQ7LG56 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms