Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC23Q6ZST2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC23Q6ZST2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZCCHC23Q6ZST2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC23Q6ZST2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms