Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFCAB12Q6NXP0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EFCAB12Q6NXP0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EFCAB12Q6NXP0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFCAB12Q6NXP0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms