Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMBRD2Q68DH5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMBRD2Q68DH5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMBRD2Q68DH5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMBRD2Q68DH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD2Q68DH5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD2Q68DH5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD2Q68DH5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD2Q68DH5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMBRD2Q68DH5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMBRD2Q68DH5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms