Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CARD17Q5XLA6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CARD17Q5XLA6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CARD17Q5XLA6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms