Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1orf53Q5VUE5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.57■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.55■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
C1orf53Q5VUE5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
C1orf53Q5VUE5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1orf53Q5VUE5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms