Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN1P1Q5VSP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN1P1Q5VSP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN1P1Q5VSP4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN1P1Q5VSP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms