Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPO2Q5TGU0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPO2Q5TGU0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSPO2Q5TGU0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TSPO2Q5TGU0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSPO2Q5TGU0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms