Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
FRMPD1Q5SYB0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.69
FRMPD1Q5SYB0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FRMPD1Q5SYB0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
FRMPD1Q5SYB0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
FRMPD1Q5SYB0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms