Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TIMM23BQ5SRD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM23BQ5SRD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM23BQ5SRD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM23BQ5SRD1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms