Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHC1Q5JVL4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHC1Q5JVL4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHC1Q5JVL4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHC1Q5JVL4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHC1Q5JVL4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EFHC1Q5JVL4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFHC1Q5JVL4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EFHC1Q5JVL4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms