Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP78Q5JTW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP78Q5JTW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP78Q5JTW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms