Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
COBLL1Q53SF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COBLL1Q53SF7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COBLL1Q53SF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COBLL1Q53SF7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms