Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSM3Q53FZ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM3Q53FZ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM3Q53FZ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM3Q53FZ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms