Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM30BQ3MIR4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM30BQ3MIR4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM30BQ3MIR4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms