Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEACAM16Q2WEN9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEACAM16Q2WEN9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEACAM16Q2WEN9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM16Q2WEN9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM16Q2WEN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM16Q2WEN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM16Q2WEN9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM16Q2WEN9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM16Q2WEN9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM16Q2WEN9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM16Q2WEN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEACAM16Q2WEN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms