Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85BQ15834 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85BQ15834 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC85BQ15834 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC85BQ15834 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC85BQ15834 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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