Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IHHQ14623 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IHHQ14623 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IHHQ14623 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IHHQ14623 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IHHQ14623 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IHHQ14623 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IHHQ14623 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IHHQ14623 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IHHQ14623 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IHHQ14623 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IHHQ14623 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IHHQ14623 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IHHQ14623 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IHHQ14623 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IHHQ14623 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IHHQ14623 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IHHQ14623 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IHHQ14623 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IHHQ14623 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IHHQ14623 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IHHQ14623 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IHHQ14623 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IHHQ14623 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IHHQ14623 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IHHQ14623 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IHHQ14623 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IHHQ14623 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IHHQ14623 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IHHQ14623 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IHHQ14623 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IHHQ14623 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IHHQ14623 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IHHQ14623 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IHHQ14623 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IHHQ14623 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IHHQ14623 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IHHQ14623 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IHHQ14623 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IHHQ14623 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IHHQ14623 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IHHQ14623 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IHHQ14623 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IHHQ14623 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IHHQ14623 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IHHQ14623 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IHHQ14623 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IHHQ14623 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IHHQ14623 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IHHQ14623 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IHHQ14623 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IHHQ14623 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IHHQ14623 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IHHQ14623 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IHHQ14623 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IHHQ14623 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IHHQ14623 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IHHQ14623 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IHHQ14623 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IHHQ14623 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IHHQ14623 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IHHQ14623 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IHHQ14623 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IHHQ14623 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IHHQ14623 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IHHQ14623 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IHHQ14623 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IHHQ14623 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IHHQ14623 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IHHQ14623 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IHHQ14623 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IHHQ14623 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IHHQ14623 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IHHQ14623 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IHHQ14623 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IHHQ14623 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IHHQ14623 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IHHQ14623 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IHHQ14623 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IHHQ14623 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IHHQ14623 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IHHQ14623 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IHHQ14623 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IHHQ14623 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IHHQ14623 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IHHQ14623 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IHHQ14623 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IHHQ14623 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IHHQ14623 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IHHQ14623 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IHHQ14623 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IHHQ14623 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IHHQ14623 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IHHQ14623 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IHHQ14623 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IHHQ14623 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IHHQ14623 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IHHQ14623 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IHHQ14623 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IHHQ14623 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms