Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SQLEQ14534 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SQLEQ14534 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SQLEQ14534 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SQLEQ14534 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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