Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN5AQ14524 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN5AQ14524 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN5AQ14524 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
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