Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL1Q13616 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL1Q13616 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL1Q13616 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL1Q13616 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL1Q13616 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL1Q13616 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL1Q13616 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL1Q13616 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL1Q13616 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CUL1Q13616 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
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