Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PWP1Q13610 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PWP1Q13610 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PWP1Q13610 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms