Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIPK1Q13546 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIPK1Q13546 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RIPK1Q13546 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPK1Q13546 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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