Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EIF4EBP1Q13541 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EIF4EBP1Q13541 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EBP1Q13541 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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