Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRDNQ13061 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRDNQ13061 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRDNQ13061 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
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