Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZGT2

NEXN, Nexilin, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXNQ0ZGT2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEXNQ0ZGT2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEXNQ0ZGT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEXNQ0ZGT2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEXNQ0ZGT2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEXNQ0ZGT2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEXNQ0ZGT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NEXNQ0ZGT2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NEXNQ0ZGT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
NEXNQ0ZGT2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NEXNQ0ZGT2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms