Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP4Q09028 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP4Q09028 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBBP4Q09028 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms