Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4DQ08499 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE4DQ08499 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE4DQ08499 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms