Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXM1Q08050 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXM1Q08050 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXM1Q08050 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXM1Q08050 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXM1Q08050 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXM1Q08050 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXM1Q08050 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXM1Q08050 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms