Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPARAQ07869 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPARAQ07869 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPARAQ07869 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPARAQ07869 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPARAQ07869 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms