Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CKAP4Q07065 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CKAP4Q07065 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CKAP4Q07065 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms