Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF9Q07011 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TNFRSF9Q07011 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNFRSF9Q07011 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNFRSF9Q07011 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms