Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PSME1Q06323 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PSME1Q06323 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PSME1Q06323 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PSME1Q06323 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms