Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIM1P81133 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIM1P81133 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIM1P81133 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIM1P81133 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIM1P81133 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIM1P81133 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIM1P81133 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIM1P81133 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIM1P81133 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIM1P81133 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIM1P81133 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIM1P81133 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIM1P81133 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIM1P81133 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIM1P81133 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIM1P81133 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIM1P81133 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIM1P81133 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIM1P81133 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIM1P81133 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIM1P81133 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIM1P81133 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIM1P81133 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIM1P81133 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIM1P81133 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIM1P81133 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIM1P81133 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SIM1P81133 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIM1P81133 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIM1P81133 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIM1P81133 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIM1P81133 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIM1P81133 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIM1P81133 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIM1P81133 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIM1P81133 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIM1P81133 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIM1P81133 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIM1P81133 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIM1P81133 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIM1P81133 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIM1P81133 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIM1P81133 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIM1P81133 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIM1P81133 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIM1P81133 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIM1P81133 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIM1P81133 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIM1P81133 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIM1P81133 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIM1P81133 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIM1P81133 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIM1P81133 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIM1P81133 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIM1P81133 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIM1P81133 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIM1P81133 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIM1P81133 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIM1P81133 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIM1P81133 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIM1P81133 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIM1P81133 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIM1P81133 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIM1P81133 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIM1P81133 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIM1P81133 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIM1P81133 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIM1P81133 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIM1P81133 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIM1P81133 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIM1P81133 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIM1P81133 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIM1P81133 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIM1P81133 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIM1P81133 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIM1P81133 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIM1P81133 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIM1P81133 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIM1P81133 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIM1P81133 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIM1P81133 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIM1P81133 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIM1P81133 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIM1P81133 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIM1P81133 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIM1P81133 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIM1P81133 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIM1P81133 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIM1P81133 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms