Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERV-K104P61576 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERV-K104P61576 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERV-K104P61576 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERV-K104P61576 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERV-K104P61576 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HERV-K104P61576 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms