Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVFC1-1P60608 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFC1-1P60608 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVFC1-1P60608 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms