Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EEFSECP57772 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EEFSECP57772 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEFSECP57772 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms