Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB38P57729 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB38P57729 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB38P57729 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB38P57729 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB38P57729 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB38P57729 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB38P57729 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB38P57729 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB38P57729 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB38P57729 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB38P57729 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB38P57729 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB38P57729 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB38P57729 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB38P57729 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB38P57729 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB38P57729 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB38P57729 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB38P57729 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB38P57729 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB38P57729 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB38P57729 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB38P57729 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB38P57729 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB38P57729 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB38P57729 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB38P57729 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB38P57729 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB38P57729 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB38P57729 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB38P57729 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB38P57729 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB38P57729 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB38P57729 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB38P57729 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB38P57729 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB38P57729 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB38P57729 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB38P57729 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB38P57729 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB38P57729 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB38P57729 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB38P57729 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB38P57729 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB38P57729 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB38P57729 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB38P57729 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB38P57729 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB38P57729 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB38P57729 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB38P57729 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB38P57729 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB38P57729 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB38P57729 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB38P57729 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB38P57729 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB38P57729 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB38P57729 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB38P57729 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB38P57729 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB38P57729 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB38P57729 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB38P57729 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB38P57729 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB38P57729 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB38P57729 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB38P57729 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB38P57729 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB38P57729 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB38P57729 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB38P57729 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB38P57729 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB38P57729 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB38P57729 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB38P57729 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB38P57729 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB38P57729 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB38P57729 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB38P57729 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB38P57729 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB38P57729 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB38P57729 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB38P57729 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB38P57729 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB38P57729 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB38P57729 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB38P57729 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB38P57729 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB38P57729 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB38P57729 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB38P57729 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB38P57729 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB38P57729 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB38P57729 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB38P57729 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB38P57729 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB38P57729 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB38P57729 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB38P57729 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms